Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1701078	1701298	221	5 [0]	[0] 14	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

CCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGC  >  minE/1701299‑1701360 |                                                              ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:1086373/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:1193425/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:309299/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:392766/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:549398/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:592334/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:663092/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:681878/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:741238/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:745310/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:835682/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:865945/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:959992/62‑1 (MQ=255) ccAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGc  <  1:986064/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGCGCCCGTAATTTGGCATTTTCCGC  >  minE/1701299‑1701360

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑