Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1742537	1742646	110	11 [0]	[0] 28	rpoE	RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor

CTCCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTA  >  minE/1742647‑1742706 |                                                            ctcCCTTCTGGACCGGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:934198/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCTTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:514343/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:968013/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:1103452/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:913483/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:820275/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:805501/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:772910/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:749187/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:6938/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:597924/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:593606/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:547597/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:539390/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:527976/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:457258/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:435285/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:395720/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:375956/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:373529/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:370730/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:369325/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:289707/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:221120/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:16466/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:1145386/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:1121397/60‑1 (MQ=255) ctcCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTa  <  1:1121029/60‑1 (MQ=255) |                                                            CTCCCTTCTGGACCCGTTCAACCAGGACCTGGTCCGTTAACTGCTCGCTCATCCGAGGTA  >  minE/1742647‑1742706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑