Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1800636	1800799	164	44 [0]	[0] 80	proX	glycine betaine transporter subunit

CCACCAGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGAA  >  minE/1800800‑1800853 |                                                      ccaccaTCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1028681/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAggggta  <  1:134156/54‑3 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:737000/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:471605/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:728343/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:727980/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:719110/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:707582/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:700641/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:698397/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:680676/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:644576/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:641521/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:596796/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:583377/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:576785/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:537639/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:528/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:514086/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:487570/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:47317/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:99903/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:855792/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1018872/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:982241/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:969865/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:948496/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:92360/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:910665/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:888726/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:878380/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:861311/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:747078/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:853195/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:852208/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:838217/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:833065/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:789872/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:753151/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:750923/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:750380/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1173799/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:205481/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:192597/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:174497/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:169374/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:166627/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:144937/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:134145/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:129226/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1201084/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:211326/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1147667/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1139081/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1122416/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1115807/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1103180/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1086956/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1086159/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1079358/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:1062013/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:269413/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:426755/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:420172/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:408822/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:394180/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:37464/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:34035/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:332143/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:286193/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:28280/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:433894/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:260717/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:253047/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:250046/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:249969/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:246254/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:245953/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:245875/54‑1 (MQ=255) ccaccaGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGaa  <  1:21265/54‑1 (MQ=255) |                                                      CCACCAGCTTGCCGCGTATGAACTGACCAACACCGTGACGCATAATCAGGGGAA  >  minE/1800800‑1800853

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑