Missing coverage evidence...
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CCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTG  >  minE/1817676‑1817737 |                                                              ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCTATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:1071304/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:804813/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:548178/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:65608/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:680093/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:730782/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:741075/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:761340/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:776135/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:776906/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:793438/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:474903/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:89612/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:899346/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:936092/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:971885/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:973515/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:978348/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:987715/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:1020870/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:103789/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:1105807/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:1131593/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:1147811/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:172732/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:2088/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:241021/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:256274/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:269810/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:293620/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:378915/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:38409/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:386689/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:391630/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:422067/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:537214/62‑1 (MQ=255) ccaCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGATGCTGTGGTTGTAACGGGTg  <  1:265411/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTG  >  minE/1817676‑1817737

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑