Missing coverage evidence...
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GAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACGCGC  >  minE/1822808‑1822869 |                                                              gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:430240/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:989452/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:848867/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:828842/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:795344/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:74668/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:722961/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:69357/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:620297/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:582648/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:533425/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:448046/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:108045/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:404471/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:371665/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:351984/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:303721/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:291575/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:212815/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:12948/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:127936/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:1175861/62‑1 (MQ=255) gAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACgcgc  <  1:1158260/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAAGTGGATGCGGTAATTGCCGCCACCGGACTGCGCCCGGAAACCGCCCTGGCACGACGCGC  >  minE/1822808‑1822869

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑