Missing coverage evidence...
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GCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGGCGC  >  minE/1866881‑1866942 |                                                              gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATAc                >  1:114160/1‑48 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:360501/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:983718/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:910789/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:896169/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:861295/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:84746/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:846523/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:811927/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:753006/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:701834/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:677043/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:670989/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:658549/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:505547/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:469922/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:393547/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:1091761/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:354554/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:344365/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:282189/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:269870/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:22669/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:225978/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:19600/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:191135/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:1194008/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:1183311/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:1179468/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:1162462/1‑62 (MQ=255) gCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGgcgc  >  1:1137784/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCACATAGCCTACGGTCCACACCACGCTGAATGCGCCCAGCAAAATACCGCGATGGCGGCGC  >  minE/1866881‑1866942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑