Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1896004	1896040	37	24 [0]	[0] 50	amiC	N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase

CTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGA  >  minE/1896041‑1896102 |                                                              cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAAt      >  1:522071/1‑58 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTg   >  1:1143900/1‑61 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:765374/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:538757/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:556979/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:571662/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:612163/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:643690/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:671955/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:693371/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:702408/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:71145/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:75708/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:75967/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:513917/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:786169/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:800527/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:878344/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:878993/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:890662/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:892753/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:906330/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:910124/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:955290/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:962166/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:96429/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1166379/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1022404/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1035633/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1057819/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1059696/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1066825/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1073342/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1076812/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:113401/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1145657/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1156668/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1165133/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1001419/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:1173170/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:124698/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:168938/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:204972/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:232123/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:296626/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:305554/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:3331/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:353272/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:360581/1‑62 (MQ=255) cTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGa  >  1:484511/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTGACATGCCTCTCCCGAGCAAAAGAAATCTAAGCTGTGTAACAAGTAAACGACTAATTTGA  >  minE/1896041‑1896102

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑