Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,763,5370GA69.3% 3.3 / 98.1 114noncoding (307/1542 nt)rrsG16S ribosomal RNA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (35/0);  new base A (79/0);  total (114/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.52e-01
Rejected as consensus: E-value score below prediction cutoff.
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 115 total aligned reads displayed.

TTCCAGTGTGGCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCTAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCCCACCAACAA  >  minE/1763523‑1763595
              |                                                          
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:660573/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:633905/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:630399/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:627348/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:559983/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:525909/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:428586/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:386700/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:370983/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:369602/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:468031/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:990908/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:98855/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:977326/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:963064/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:930943/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:92420/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:907431/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:881251/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:710325/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:846747/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:833936/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:833645/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:822607/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:788986/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:77844/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:747803/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:733371/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1147017/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:16192/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:153867/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1199577/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:355892/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1173393/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1158877/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1147028/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:118642/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1139884/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1088516/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1072075/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:1037117/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:290218/1‑53 (MQ=11)
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ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:225753/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTAGCCTTGGTg                      >  1:503500/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTGATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCCTCGCCTTGGTg                      >  1:351639/1‑53 (MQ=11)
ttCCAGTGTGACTAATCATCCTCTCAGACCAGTTACGGATCGTCGCCTTGGTg                      >  1:729999/1‑53 (MQ=11)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGTGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:117889/1‑60 (MQ=11)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGtt               >  1:758364/1‑51 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:1096592/1‑60 (MQ=255)
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         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:134251/1‑60 (MQ=255)
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         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:907843/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:917707/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:386455/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:37396/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:951849/1‑60 (MQ=255)
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         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:72317/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:710637/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:244535/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCccacca      >  1:482895/1‑60 (MQ=255)
         ggCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCCAGGGATCGTCGCCTT‑GTGAGCCGTTACCCCACcaaca   >  1:743105/1‑62 (MQ=14)
              |                                                          
TTCCAGTGTGGCTGGTCATCCTCTCAGACCAGCTAGGGATCGTCGCCTTGGTGAGCCGTTACCCCACCAACAA  >  minE/1763523‑1763595

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑