Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,532,618	C→A	L36L (CTG→CTT)	aroC ←	chorismate synthase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,532,618	0	C	A	100.0%	104.8 / NA	32	L36L (CTG→CTT)	aroC	chorismate synthase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/32);  total (0/32)

GCAGGTCCGCTTCCGTCAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAGCGC  >  minE/1532602‑1532662                 |                                             gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:475562/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:991175/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:905181/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:896166/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:886431/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:87726/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:797365/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:768440/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:75919/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:674481/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:654024/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:618270/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:593809/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:56833/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:513086/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:478770/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:1032017/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:45513/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:445990/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:437897/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:371431/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:349014/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:239679/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:218791/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:1170278/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:1132220/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:1085642/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:108276/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:10438/61‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:1042165/61‑1 (MQ=255)  cAGGTCCGCTTCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:188748/60‑1 (MQ=255)            tCCGTAAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAgcgc  <  1:463736/50‑1 (MQ=255)                 |                                             GCAGGTCCGCTTCCGTCAGCGGAATGCCTGGCGGAACACCATCGACGATGCAGCCGAGCGC  >  minE/1532602‑1532662

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑