Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,920,139	G→A	T254M (ACG→ATG)	ygeD ←	predicted inner membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,920,139	0	G	A	100.0%	129.3 / NA	39	T254M (ACG→ATG)	ygeD	predicted inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/39);  total (0/39)

AATCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCGTAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCACC  >  minE/1920108‑1920168                                |                              aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:429136/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1027988/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:333101/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:335581/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:335839/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:34905/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:399553/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:402095/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:420188/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:333093/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:473461/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:531506/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:538567/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:544529/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:732760/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:8383/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:961580/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:974613/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:148397/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1055476/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1119490/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1146228/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1156457/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1166338/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1190817/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:1195149/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:312028/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:151867/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:155775/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:19035/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:19250/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:295823/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:303344/61‑1 (MQ=255) aaTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:308830/61‑1 (MQ=255)  aTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:457754/60‑1 (MQ=255)  aTCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:250999/60‑1 (MQ=255)          cATCGCGTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:696990/52‑1 (MQ=255)               cgTTGAGATAGGTGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:397337/47‑1 (MQ=255)                           tGGGCATAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCAcc  <  1:135535/35‑1 (MQ=255)                                |                              AATCGCTACCATCGCGTTGAGATAGGTGGGCGTAGCGTTATCGGTAATGCCCAGCGCCACC  >  minE/1920108‑1920168

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑