Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	599,981	A→C	D775A (GAC→GCC)	dmsA →	dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	599,981	0	A	C	100.0%	231.6 / NA	63	D775A (GAC→GCC)	dmsA	dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (0/63);  total (0/63)

CGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACG  >  minE/599930‑599996                                                    |                cGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1161847/62‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTTTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:649751/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTTGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:53319/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGTACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:837743/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCTGATGCa       <  1:1070669/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:486972/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:582309/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:576826/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:568385/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:514545/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:736872/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:48029/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:454599/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:449489/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:442772/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1007787/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:430418/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:681523/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:437192/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:762743/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:774529/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:862611/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:86859/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:871100/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:88369/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:902761/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:903027/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:917619/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:978191/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:99786/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:199054/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1042080/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1081290/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1111891/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1119695/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:1142095/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:114652/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:170835/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:180550/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:192559/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:422662/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:213354/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:216851/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:279242/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:413214/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:358319/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:348174/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:346447/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:258089/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:278382/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:266218/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:258111/61‑1 (MQ=255)  gCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGCTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:292506/61‑1 (MQ=255)   ccACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:276570/60‑1 (MQ=255)   ccACGAATGATGCCGGGTGTGGGCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:957044/60‑1 (MQ=255)      cGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCAAAACg  <  1:840015/62‑1 (MQ=255)      cGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCAAAACg  <  1:1185631/62‑1 (MQ=255)      cGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCAAAACg  <  1:350683/62‑1 (MQ=255)      cGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCAAAACg  <  1:754681/62‑1 (MQ=255)      cGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCAAAACg  <  1:1066691/62‑1 (MQ=255)       gAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:79374/56‑1 (MQ=255)          tgatgCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCAAAACg  <  1:786404/58‑1 (MQ=255)                     gtgGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGCCCCGGATGCa       <  1:842252/42‑1 (MQ=255)                                                    |                CGCCACGAATGATGCCGGGTGTGGTCGCACTGGGTGAAGGTGCCTGGTATGACCCGGATGCAAAACG  >  minE/599930‑599996

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑