Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 2,257,468 T→G V1225V (GTA→GTC rpoB ← RNA polymerase, beta subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,257,4680TG100.0% 191.3 / NA 53V1225V (GTA→GTCrpoBRNA polymerase, beta subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (0/53);  total (0/53)

TTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATC  >  minE/2257442‑2257503
                          |                                   
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TTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATC  >  minE/2257442‑2257503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: