Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	2,889,842	C→T	R126H (CGT→CAT)	msrA ←	methionine sulfoxide reductase A

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	2,889,842	0	C	T	100.0%	288.5 / NA	87	R126H (CGT→CAT)	msrA	methionine sulfoxide reductase A
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (14/73);  total (14/73)

GGTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGACGCATTCCCTGGGCGGGATC  >  minE/2889790‑2889861                                                     |                    ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:724447/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:540039/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:578217/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:488331/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:372850/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:337874/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:768897/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:785286/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:832495/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:1095289/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:853137/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:92636/1‑62 (MQ=255) ggTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCt            >  1:1019622/1‑62 (MQ=255) cgTCAGCGGATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTTGTCATTGCCATGATGCAttac              >  1:453840/2‑58 (MQ=255)        ggATAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCC‑‑‑GTCATTGCCCTGATGCATTCCCTGGGCGGGATc  <  1:704630/62‑1 (MQ=255)           tAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCTGGGCGGGATc  <  1:606707/62‑1 (MQ=255)           tAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCTGGGCGGGATc  <  1:612746/62‑1 (MQ=255)           tAAATCGCTGAACGATACTGCGTGCCGTGGTCATTGCCCTGATGCATTCCCTGGGCGGGATc  <  1:588351/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑