Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | minE | 2,257,484 | 2 bp→GC | coding (3658‑3659/4029 nt) | rpoB ← | RNA polymerase, beta subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | minE | 2,257,484 | 0 | T | G | 100.0% | 191.3 / NA | 53 | Q1220A (CAG→GCG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (0/53); total (0/53) | |||||||||||
* | minE | 2,257,485 | 0 | G | C | 100.0% | 195.4 / NA | 53 | Q1220A (CAG→GCG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (0/53); total (0/53) |
TTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATC > minE/2257442‑2257503 || ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:75966/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:57842/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:592704/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:597968/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:607460/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:619203/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:637705/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:644094/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:657956/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:674301/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:69580/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:726958/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:728414/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:756413/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:529074/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:774176/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:799378/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:805659/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:809593/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:831672/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:84185/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:847378/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:880078/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:884938/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:896357/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:903048/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:944676/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:201311/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1023732/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1034040/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1085858/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1159067/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1162188/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1164632/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1190820/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:143224/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:163729/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:174650/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:193684/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:199750/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:1019472/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:217923/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:221331/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:280013/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:284405/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:29284/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:292896/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:30261/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:417937/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:452781/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:483075/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:518744/62‑1 (MQ=255) ttCAGCATGTGCATGAAGCCGACGGTGACCTTGCGCTCGAACGCTTCGCCGGTGCGGCCGTc < 1:524869/62‑1 (MQ=255) || TTCAGCATGTACATGTAACCAACGGTTACCGGACGCTCGAACTGTTCACCAGTGCGACCATC > minE/2257442‑2257503 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |