Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,520,486	+C	coding (403/813 nt)	truA ←	pseudouridylate synthase I

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,520,482	1	.	C	100.0%	72.2 / NA	20	V136G (GTA→GGA)	truA	pseudouridylate synthase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base C (0/20);  total (0/20)

TGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTA‑CCCCTTTACTCAGTACCGCCG  >  minE/1520443‑1520503                                         |                      tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:248548/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:941783/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:911243/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:907453/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:879742/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:831976/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:781151/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:756052/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:385804/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:2737826/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:1040913/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:2183687/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:2150289/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:1835900/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:1799668/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:1624132/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:157995/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:1255898/62‑1 (MQ=255) tGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:1141306/62‑1 (MQ=255)  gCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTACCCCCTTTACTCAGTAccgccg  <  1:2404912/61‑1 (MQ=255)                                         |                      TGCATCCGTTCAGCGTCCAGCGGTTCGTAAAAATGGGTTA‑CCCCTTTACTCAGTACCGCCG  >  minE/1520443‑1520503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑