Missing coverage evidence...
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GCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATC  >  minE/1996004‑1996065                                                              | gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:424845/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2382636/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2406700/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2611669/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2751481/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2793679/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2802957/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:3036220/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:3079669/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:3097355/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:3260143/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2355292/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:596602/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:642273/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:679702/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:824934/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:833732/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:91127/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:921153/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:968917/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:977153/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:986072/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2306446/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:112669/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:118276/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1507533/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1516342/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1619977/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1630057/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1645217/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1711868/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1841232/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1870005/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1972859/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1979314/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1995710/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1996433/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2185040/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2230701/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:1029952/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCATAAAATc  <  1:1152959/62‑1 (MQ=255) gCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGACGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2403696/62‑1 (MQ=255)       aTGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:2167379/56‑1 (MQ=255)            aCTGCGACTATCCGTAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAATATc  <  1:1042584/51‑1 (MQ=255)                    tATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATc  <  1:135603/43‑1 (MQ=255)                                                              | GCAAGAATGCCACTGCGACTATCCGCAGCGGTAATGACGACTGCCGCGACGTCCGTAAAATC  >  minE/1996004‑1996065

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑