Missing coverage evidence...
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AAGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTC  >  minE/2003463‑2003524                                                              | aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:326823/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:285153/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2649035/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2632234/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2452196/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:3203142/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2243610/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1062033/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2151251/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2009626/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1842958/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1766452/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:3270883/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1576039/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:382786/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1502893/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:4516/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1223786/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:92695/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1179739/62‑1 (MQ=255) aaGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:957273/62‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2215260/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:3216555/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:624488/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:874878/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:2947086/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:237835/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:196292/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1694359/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1668393/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1571178/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1426904/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1330014/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1242483/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:1203727/61‑1 (MQ=255)  agagagATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTc  <  1:106779/61‑1 (MQ=255)                                                              | AAGAGAGATCGTGCATCGAACGCCGGGCAATTTCTTCAAACGCTGCCTGTACTTGCGCCTTC  >  minE/2003463‑2003524

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑