Missing coverage evidence...
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CTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCT  >  minE/2018808‑2018869                                                              | cTGAAAGAGCCAGAAGACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:3207705/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2432545/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1187984/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2473777/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2572429/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2633800/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2683024/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:280968/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:3008602/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:3167377/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:3172113/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:3183677/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:333284/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:36265/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:501903/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:51562/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:568143/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:589924/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:963476/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:977737/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:997496/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1668622/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1171559/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1195996/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1324840/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1375285/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1465381/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:159456/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1653433/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:166008/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2222278/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:183255/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1841599/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2087954/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2115585/62‑1 (MQ=255) cTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2138710/62‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:308958/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:3133268/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1590618/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1473437/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2681166/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1292689/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2490630/61‑1 (MQ=255)  tGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGGGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:1476216/61‑1 (MQ=255)          ccAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2776381/53‑1 (MQ=255)                   tACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2213781/44‑1 (MQ=255)                      gATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCt  <  1:2777122/41‑1 (MQ=255)                                                              | CTGAAAGAGCCAGAAAACTACGATGTGCGCGCCAACGTCATGTGGGCGGCGACTCAGGCGCT  >  minE/2018808‑2018869

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑