Missing coverage evidence...
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GGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACG  >  minE/2081428‑2081469                                          | ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2292534/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:928133/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:717145/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:52031/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:520176/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:384781/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:364945/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:3258495/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:3135629/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:3129777/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:301790/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2994438/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2817677/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2804147/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2521203/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2336348/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1637151/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1323952/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1353846/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1450631/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1523842/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1574408/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1608529/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1629053/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1129997/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1788531/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1869665/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1951730/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:1955457/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2184670/42‑1 (MQ=255) ggtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2264731/42‑1 (MQ=255) ggtgggTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:2251347/42‑1 (MQ=255)  gtggtTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACg  <  1:3153357/41‑1 (MQ=255)                                          | GGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACG  >  minE/2081428‑2081469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑