Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2083290	2083294	5	39 [0]	[0] 100	yqjA	conserved inner membrane protein

TCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAT  >  minE/2083228‑2083289                                                              | tCAGCTATATTCAGGGGCGATTGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:3059081/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1221268/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2674027/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:267537/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2678003/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2820163/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2871945/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2984866/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:300644/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:3023363/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:3024861/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:3076715/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:3206671/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:394238/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:572755/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:769498/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:800157/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:917484/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:933994/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2002345/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1255538/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1288856/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1345366/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1630398/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1709748/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1832589/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1963398/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:1972709/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2655352/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2121330/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2233191/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2251451/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2303423/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2529379/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2531549/62‑1 (MQ=255) tCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2561686/62‑1 (MQ=255)  cAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:3231897/61‑1 (MQ=255)  cAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2769236/61‑1 (MQ=255)              ggggCGATGGCGGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAt  <  1:2331769/49‑1 (MQ=255)                                                              | TCAGCTATATTCAGGGGCGATGGCTGGGCAATACCCGCACCGTACAAAACTGGCTATCTCAT  >  minE/2083228‑2083289

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑