Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2089543	2089557	15	56 [0]	[0] 6	yhaK	predicted pirin‑related protein

GCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCA  >  minE/2089481‑2089542                                                              | tccccTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:947654/61‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:437580/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2800105/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2864080/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2941209/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2977008/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2979195/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2995217/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:3098006/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:3141285/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:3277631/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:342442/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:355069/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:387658/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:436418/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1104526/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:465044/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:567671/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:641371/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:643845/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:664118/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:666430/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:679736/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:685806/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:800831/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:96487/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:982134/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1756389/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1285787/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1380237/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1421985/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1210670/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:147945/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:152019/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1553427/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1191978/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1653942/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1135778/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1755389/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1884555/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1059946/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1923203/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1941061/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2047558/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2138554/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:219281/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2276275/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2401222/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:248544/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:2555450/62‑1 (MQ=255) gCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTAACCGAACTGCCa  <  1:2637266/62‑1 (MQ=255)  ccccTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1339056/61‑1 (MQ=255)  ccccTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1892579/61‑1 (MQ=255)          cATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:443752/53‑1 (MQ=255)                aGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1703703/47‑1 (MQ=255)                       aaaGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCa  <  1:1478158/40‑1 (MQ=255)                                                              | GCCCCTTACCATAAAAGGAAGTAAAGAGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCA  >  minE/2089481‑2089542

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑