Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2109178	2109193	16	30 [0]	[0] 16	kbaY/agaB	tagatose 6‑phosphate aldolase 1, kbaY subunit/N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIB component of PTS

AATGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTTAA  >  minE/2109116‑2109177                                                              | aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2189739/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:927168/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:672851/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:488779/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:3286808/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:3251190/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:3238117/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:3125333/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2947451/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2881528/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2657616/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2517391/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2278538/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2197938/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1006117/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2038215/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1646831/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1544890/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1380132/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1337392/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1259007/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:120025/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1185804/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1156431/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1142521/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1085669/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1016109/62‑1 (MQ=255) aaTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1009589/62‑1 (MQ=255)  aTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:1854635/61‑1 (MQ=255)  aTGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTtaa  <  1:2665615/61‑1 (MQ=255)                                                              | AATGTACTTCCCGATTAATATCGGGGAGTGCCTTAATGGAAAAGGAGATAACTAAACCTTAA  >  minE/2109116‑2109177

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑