Missing coverage evidence...
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TTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGC  >  minE/2164287‑2164348                                                              | ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2253650/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:700452/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:589121/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:507443/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:389324/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:3238850/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:3228280/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:309167/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2882255/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2723858/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2709179/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2627679/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2501415/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2470976/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:227095/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1065199/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1517129/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1075746/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1084159/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1100387/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1109561/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1377806/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1431774/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2245769/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1519016/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:152351/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1616859/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1881453/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2226450/62‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2226632/62‑1 (MQ=255)  tctcAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:1206714/61‑1 (MQ=255)         gTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:329189/54‑1 (MQ=255)          ttttAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGc  <  1:2335972/53‑1 (MQ=255)                                                              | TTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGC  >  minE/2164287‑2164348

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑