Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2170899 2170940 42 109 [0] [0] 6 rpoN RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor

Only 100 of 109 total aligned reads displayed.

TGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGAAA  >  minE/2170837‑2170898
                                                             |
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGTCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1500357/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTTAAGAATATATGaaa  <  1:1890683/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATTTATGaaa  <  1:2338108/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2975834/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3214948/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3203440/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3178441/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:316370/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3158110/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3142531/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3140477/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3063641/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3017300/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3016818/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:450575/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2963032/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2914314/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2904478/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2851298/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2840349/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2814618/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2791370/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2780741/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2764531/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2703973/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:269884/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:681268/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:99413/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:976431/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:974144/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:939907/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:836297/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:820312/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:814027/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:786881/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:766231/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:747757/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:724382/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:706725/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:3272731/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:611415/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:604306/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:580896/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:576958/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:550556/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:519373/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:497982/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:484670/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:473739/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:466556/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2688198/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1318312/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1711461/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1700698/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1696221/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1617609/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1600114/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:157368/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1552884/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1525027/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1502447/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1453735/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:13532/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2683129/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1294188/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1291636/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1268754/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1247529/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1233806/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1222273/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1215405/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1188091/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:118278/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1078691/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1776090/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1008856/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2662099/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2658335/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2503927/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2477926/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2445370/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2386339/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2366072/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2321446/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2291655/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:224012/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2219699/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2128817/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2075561/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:2058934/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1976433/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1970927/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1938495/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1847376/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:184224/62‑1 (MQ=255)
tGAGTCGCTGTATCGATGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:176944/62‑1 (MQ=255)
 gAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:625737/61‑1 (MQ=255)
 gAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:288258/61‑1 (MQ=255)
 gAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1044988/61‑1 (MQ=255)
         gTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGaaa  <  1:1413689/53‑1 (MQ=255)
                                                             |
TGAGTCGCTGTATCGTTGAACAGCAGCAAGCCTTCTTTGAGCAAGGTGAAGAATATATGAAA  >  minE/2170837‑2170898

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑