Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2239170 2239170 1 131 [0] [0] 35 zraS sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR

Only 100 of 131 total aligned reads displayed.

TCCTGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTCA  >  minE/2239131‑2239169
                                      |
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCTCCGTGTTGTTca  <  1:2475020/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2661331/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3068775/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3013923/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2996447/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2899079/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2892369/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2890905/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2877054/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2833595/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:283025/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2773358/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2768536/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2695900/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3081876/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2637664/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2634865/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:262368/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:260007/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2593109/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2559755/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2497776/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2487464/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2376793/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1036284/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:587934/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:971323/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:960886/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:953624/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:9035/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:879614/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:835825/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:831222/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:794598/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:700090/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:629293/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:601939/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2373056/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:562589/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:551475/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:507317/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:45798/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:363455/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:329623/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3292742/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3262762/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3215202/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:3195315/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:317337/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1296403/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:235911/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1640202/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1619833/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1619125/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1592484/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1479018/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1397980/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1381020/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1355153/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1338622/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1306452/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1645761/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1276930/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1275827/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1208259/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1188605/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1181664/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1148187/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1142849/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1116898/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1107038/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1098734/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2035498/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2242207/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2239619/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2262683/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2225645/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2204069/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2144757/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2318109/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2142656/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2133815/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1713809/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2037981/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2017942/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1870431/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1814951/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1811733/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1797591/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1791918/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1789813/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1765869/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1747005/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1745159/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:2329877/39‑1 (MQ=255)
tcctGGCTTGCGACCTGAAATGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1277881/39‑1 (MQ=255)
 cctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:903965/38‑1 (MQ=255)
 cctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:166051/38‑1 (MQ=255)
  ctGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:688884/37‑1 (MQ=255)
   tGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTca  <  1:1169406/36‑1 (MQ=255)
                                      |
TCCTGGCTTGCGACCTGAATTGTACCACCGTGTTGTTCA  >  minE/2239131‑2239169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: