Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2239250 2239287 38 13 [0] [0] 6 zraS sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR

GCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAG  >  minE/2239188‑2239249
                                                             |
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:1018742/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:1147732/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:1561754/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:1827708/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:2268978/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:2739918/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:2870032/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:3125030/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:3172816/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:3296537/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:494509/62‑1 (MQ=255)
gCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:843960/62‑1 (MQ=255)
 ccAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAg  <  1:673377/61‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCCAGCCCCAATCCGGTGCCTTCGGCTTTAGTGGTGAAGTACGGAGTGAAGATGGCATCAAG  >  minE/2239188‑2239249

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: