Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2241347	2241373	27	14 [0]	[0] 12	yjaH	conserved hypothetical protein

AGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCT  >  minE/2241285‑2241346                                                              | aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:1457536/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:1641543/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2023617/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2333880/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2368138/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2438384/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2465623/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2482798/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:362642/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:378129/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:580577/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:707479/62‑1 (MQ=255) aGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:78502/62‑1 (MQ=255)  ggTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGGCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCt  <  1:2912575/61‑1 (MQ=255)                                                              | AGGTTTAATGGTTTGCCCTTCGCAGGTGGTCACGGTCTGTTCCATCGCATGCCAGCGCCCCT  >  minE/2241285‑2241346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑