Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2258964	2258997	34	7 [0]	[0] 108	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

ACCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCA  >  minE/2258902‑2258963                                                              | aCCTTCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:3195488/1‑62 (MQ=255) aCCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:1559121/1‑62 (MQ=255) aCCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:1692552/1‑62 (MQ=255) aCCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:1949320/1‑62 (MQ=255) aCCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:2555719/1‑62 (MQ=255) aCCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:3251746/1‑62 (MQ=255) aCCTGCTTCACCAGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCa  >  1:75607/1‑62 (MQ=255)                                                              | ACCTGCTTCACCCGGATACATCTCGTCTTCGTTAACTTTGATAACGATACGGGAAGCATCCA  >  minE/2258902‑2258963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑