Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2259198	2259211	14	58 [0]	[0] 3	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCT  >  minE/2259136‑2259197                                                              | cGGGATCAGGGTCGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1026735/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACGGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2488909/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGTCGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1465819/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2840992/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:200720/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2130785/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2222776/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2262332/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2276753/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2309813/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2354705/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1020783/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2595005/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2635825/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2790052/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2803494/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2832407/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:944239/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:946814/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2943701/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2944771/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:297877/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:2993687/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:3049801/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:3190149/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:327508/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:57241/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:595378/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:681481/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:693562/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1483060/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1046481/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1072867/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1076318/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1091782/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1160056/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1254189/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1296080/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:130869/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:132497/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1366863/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:138292/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1463134/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1995210/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1523434/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:153741/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1685922/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1688621/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1689812/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1797548/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1809026/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1862026/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1865800/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1891328/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1933928/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:1978596/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:199287/1‑62 (MQ=255) cGGGATCAGGGACGCACAGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCt  >  1:108614/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGGGATCAGGGACGCACCGACGGATACCACCTGCTGGGTGGATACGTCCATGTAGTCAACCT  >  minE/2259136‑2259197

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑