Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2283984	2284032	49	67 [0]	[0] 27	oxyR/argH	DNA‑binding transcriptional dual regulator/argininosuccinate lyase

GTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATAA  >  minE/2283922‑2283983                                                              | gTTCATGGCGATAGGTAGAATGGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2745561/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAATGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:273886/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2760420/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:3260225/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:322979/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:3196987/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:3103484/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:3065036/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2976303/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2926823/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2877033/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:326091/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2744255/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2728013/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2701786/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2663121/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1026104/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2606688/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:3287940/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:3290679/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:487019/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:520927/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:524763/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:538202/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:586897/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:607069/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:623360/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:623827/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:787357/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:795129/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:821848/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:823886/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:827633/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1548936/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2601034/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1757392/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1689129/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1671570/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1660355/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1650222/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1634665/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1599401/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1770241/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1514695/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1496863/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1431423/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1291576/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1255203/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1253955/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1195427/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2266259/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2569991/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2548113/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2533110/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2501074/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2465481/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2422424/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2349640/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2051120/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2021729/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2014919/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1948044/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1930789/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:1877716/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCACTCTGACTGATaa  >  1:656355/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCGAGAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:2972299/1‑62 (MQ=255) gTTCATGGCAATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATaa  >  1:177270/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTTCATGGCGATAGGTAGAATAGCAATGAACGATTATCCCTATCAAGCATTCTGACTGATAA  >  minE/2283922‑2283983

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑