Missing coverage evidence...
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CCAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTGC  >  minE/2316917‑2316978                                                              | ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:3038514/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1027130/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2444639/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2449928/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2450598/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2499177/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:25458/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2661427/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2698063/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2733415/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2901979/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2422791/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:3096569/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:312981/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:3166420/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:3283991/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:389766/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:467959/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:621895/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:83013/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:946931/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:960414/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2026988/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1163336/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1440683/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1506181/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1514866/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1519109/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1675079/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1788913/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1827088/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1863278/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2397499/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2030032/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2061895/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2146599/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2146931/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2204994/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2356859/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2371364/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2386669/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTCTCTgc  <  1:358342/62‑1 (MQ=255) ccAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGATGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2204305/62‑1 (MQ=255)  cAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:2532520/61‑1 (MQ=255)  cAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTgc  <  1:1369100/61‑1 (MQ=255)                                                              | CCAGACAGCGAAGTTGACGTGCTGTACGGTATTGGTGGCGCGCCGGAAGGCGTAGTTTCTGC  >  minE/2316917‑2316978

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑