Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2326247	2326282	36	97 [0]	[0] 29	cpxR	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with CpxA

TTAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATC  >  minE/2326188‑2326246                                                           | ttAGCGACGTCTGATGAGGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2781524/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGTCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2021723/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1677726/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3143524/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1718172/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1726246/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:176215/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1764626/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1822470/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:719601/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2693038/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:409790/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1866817/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2010879/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2023738/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:266448/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2040184/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2062922/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2159862/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2166090/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:225711/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2640070/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:611264/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2631719/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2425951/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2570669/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1646522/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1213797/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:313305/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1258347/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3192955/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1295714/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1326211/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1351978/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1355765/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1398276/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3085223/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3031170/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:322315/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1459192/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1473953/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:822456/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:816031/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:153935/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1581504/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2744382/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:806892/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1626380/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:805130/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2735577/59‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTCTGATGACGTAATTCCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1936308/59‑1 (MQ=255)  tAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAATATc  <  1:489805/58‑1 (MQ=255)  tAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1114665/58‑1 (MQ=255)  tAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2330259/58‑1 (MQ=255)  tAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1401893/58‑1 (MQ=255)          tCTTATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1843587/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3282408/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3186819/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:935170/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1107688/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:917873/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:897767/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:87249/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3276038/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:825512/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:525510/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:813026/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:794529/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:707181/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:63717/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:438746/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:579727/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1849522/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1251506/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1284497/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:142090/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1453414/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:147527/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1488727/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1512955/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1602330/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1613160/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1631042/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1664952/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:1838035/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3149891/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2027162/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:236976/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2377797/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2523159/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2660582/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2664959/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2779164/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2961881/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2973380/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:3089128/50‑1 (MQ=255)          tCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAAGTATTTAAACAATGAATAAAATc  <  1:2460619/50‑1 (MQ=255)                                                           | TTAGCGACGTCTGATGACGTAATTTCTGCCTCGGAGGTATTTAAACAATGAATAAAATC  >  minE/2326188‑2326246

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑