Missing coverage evidence...
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TAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTA  >  minE/198764‑198824                                                             | ttaCATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:3038812/59‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTTGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:769391/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:645932/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2422568/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2502157/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:3049211/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:3049267/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:3147651/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:402429/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:440526/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:644264/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2367202/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:712239/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:741217/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:743903/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:765989/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:770368/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:879359/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:943865/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1957457/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1032742/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1107006/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1199940/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1340829/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1361632/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:143064/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1482074/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1516325/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:167235/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:100070/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1967777/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:197045/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:1992116/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2013849/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2090783/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2137116/61‑1 (MQ=255) tAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2312425/61‑1 (MQ=255)                  ttAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTa  <  1:2306686/44‑1 (MQ=255)                                                             | TAACATGGAACAGCCGCTTAGCATGAGTGCTACTAAACAGATCGGTAAAGCACGCATAGTA  >  minE/198764‑198824

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑