Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2342470	2342483	14	35 [0]	[0] 13	glnL	sensory kinase in two‑component regulatory system with GlnG

AAATTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGA  >  minE/2342409‑2342469                                                             | aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTTAATATCGAGCTGa  >  1:1905740/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:757234/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:3041698/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:3149905/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:315453/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:3160427/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:3175607/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:3205305/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:400090/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:531261/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2812923/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:775761/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:800182/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:811557/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:825370/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:829108/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:836976/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:943768/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2154561/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1076721/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1105532/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1178863/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1448311/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1461480/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1894580/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2098891/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:213625/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2816532/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2168314/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2366793/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2478861/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2511676/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2514108/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:2579061/1‑61 (MQ=255) aaaTTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGa  >  1:1008997/1‑61 (MQ=255)                                                             | AAATTGTTTGGTACACCGTTACCGGAACTGTTGAGCTACTTCTCATTAAATATCGAGCTGA  >  minE/2342409‑2342469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑