Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2343368	2343378	11	67 [0]	[0] 52	glnG	fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)

GCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAC  >  minE/2343308‑2343367                                                            | gacTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGACGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:3098382/3‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2746264/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:3012428/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2901578/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2863636/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2835747/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2827355/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2816745/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2767004/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:3242644/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2720990/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2709516/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2587519/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2561249/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2473968/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2459730/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1000287/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2455932/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:3251940/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:3281051/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:3281723/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:354244/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:405695/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:417129/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:418903/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:513006/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:60384/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:685402/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:810694/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:872964/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:888857/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:936416/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:964592/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2333148/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1106404/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:122522/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:129055/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1370182/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1402795/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1414274/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:143594/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1441201/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1524165/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1546290/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1581244/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1606778/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1639856/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:170547/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1724681/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1774937/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2344904/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2278275/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2180600/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2164607/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2100684/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:2099366/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:20208/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1965528/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1960641/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1957977/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1956367/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1879728/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1740024/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGAATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1885804/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGAAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:1069535/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGCGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:392937/1‑60 (MQ=255) gCCTATCAGGAAATAAAGGAGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAc  >  1:810099/1‑60 (MQ=255)                                                            | GCCTATCAGGAAATAAAGGTGACGTTTATGCAACGAGGGATAGTCTGGGTAGTCGATGAC  >  minE/2343308‑2343367

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑