Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2352320	2352325	6	58 [0]	[0] 9	yihG	predicted endonuclease

GGGAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAACCAC  >  minE/2352258‑2352319                                                              | gggAAGTTCACGGGCTGGGAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1756273/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTATGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2533122/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:3271249/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2800141/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2802803/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2927090/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2927234/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2934632/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2998007/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:3068589/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:308250/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:3086001/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:3090683/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:31908/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:3225407/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:3270185/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2693404/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:37321/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:425167/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:52691/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:546656/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:552640/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:564946/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:576911/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:672808/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:71000/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:712122/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:742774/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:800282/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:959894/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1845920/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1090365/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1204222/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1435610/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1455194/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1585957/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:169288/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1694699/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1705487/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1711052/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1774018/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1789235/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1791754/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1830038/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2777932/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1875799/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1911366/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1986935/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2052426/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2106197/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2128584/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2142211/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:224364/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2278580/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2506986/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2660249/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:1017299/1‑62 (MQ=255) gggAAGTTAACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAaccac  >  1:2479937/1‑62 (MQ=255)                                                              | GGGAAGTTCACGGGCTGGAAGGGTTAAGTAAGAAGAACTGGTATCTGCTTATTTGTAACCAC  >  minE/2352258‑2352319

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑