Missing coverage evidence...
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CCGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATT  >  minE/2394964‑2395025                                                        |       ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2426986/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:975903/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:964486/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:887816/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:845209/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:806185/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:643115/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:3097180/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:3087752/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2872108/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2691045/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2624057/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2542417/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2432963/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1009121/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2227139/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:2028396/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1905993/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1697992/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1627922/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1570647/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1541799/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1502560/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1450836/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1220301/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1194607/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGttt        >  1:1164481/1‑56 (MQ=255) ccGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCttga  >  1:1685298/1‑59 (MQ=255)                                                        |       CCGGCATGTTAATCGAAACCATGTGGCTGCTGCCCGTGGCGGCAATTTACCTGTTTGCTATT  >  minE/2394964‑2395025

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑