Missing coverage evidence...
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GCAAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAAT  >  minE/2407387‑2407448                                                              | gctaGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:556181/59‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGATTCTCAat  <  1:2394690/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:3203907/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2718709/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2740116/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2828740/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2847167/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2866106/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2928259/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:3054783/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2666978/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:3249526/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:3251163/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:370544/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:429915/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:482817/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:641650/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:947141/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2590638/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2467427/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1176898/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2076448/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1998576/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1225642/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1284786/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1382047/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1626966/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:152452/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1509262/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1485107/62‑1 (MQ=255) gcaAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGGCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1155063/62‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2611054/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1782386/61‑1 (MQ=255)  caAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2297588/61‑1 (MQ=255)               cacaCGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:2981610/48‑1 (MQ=255)                      aaTTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAat  <  1:1721052/41‑1 (MQ=255)                                                              | GCAAGCGCGCGATCCACACGCAATTGATTTATGGCATCCAGTCTCTGTTTCAGAGTCTCAAT  >  minE/2407387‑2407448

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑