Missing coverage evidence...
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ATAACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGCC  >  minE/2417478‑2417537                                                            | ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:371640/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1032983/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2735486/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2768303/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2806451/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2968350/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:305062/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:3079833/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:3133366/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:327486/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:3275372/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:334442/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2684474/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:38792/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:398725/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:497110/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:515419/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:58058/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:646169/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:829717/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:908393/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:919448/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:962595/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1953150/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1099062/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1115206/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:112729/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1182726/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1227247/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1428117/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1501564/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1538524/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1775569/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1854721/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:237525/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2000928/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2063617/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2132095/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2217907/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2224998/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2244215/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2277500/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2314348/60‑1 (MQ=255) ataACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2374858/60‑1 (MQ=255)  taACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:3282813/59‑1 (MQ=255)                     cgaacgaaCCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:2750859/40‑1 (MQ=255)                       aacgaacCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGcc  <  1:1786365/38‑1 (MQ=255)                                                            | ATAACGATGCGCATAAACGGCGAACGAACCGGTAACCGGTTCGAGGAACAACATTTCGCC  >  minE/2417478‑2417537

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑