Missing coverage evidence...
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GCTGGGGCTGGGCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACACC  >  minE/2476691‑2476751                                                             | gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:3228896/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2382389/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2404635/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2440351/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2569380/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2594061/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2693540/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2825542/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2898450/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:3170191/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2238969/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:3229543/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:3255327/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:46525/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:640688/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:681521/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:710048/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:861515/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:949933/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:982231/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2202991/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:106322/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1089102/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1210470/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1361882/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1410736/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:14241/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1424782/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1447388/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1510411/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:152438/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:158214/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1704766/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2059777/61‑1 (MQ=255) gctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1003746/61‑1 (MQ=255)  ctggggctgggCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:919069/60‑1 (MQ=255)               gcgcgcTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1604899/47‑1 (MQ=255)                   gcTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:2015588/43‑1 (MQ=255)                       ggTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:10300/39‑1 (MQ=255)                         tGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1977783/37‑1 (MQ=255)                          gAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACAcc  <  1:1935080/36‑1 (MQ=255)                                                             | GCTGGGGCTGGGCCGCGCGCTCGGTGAAACCATGGCGGTGACCTTTATCATCGGTAACACC  >  minE/2476691‑2476751

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑