Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2481804 2481829 26 45 [0] [0] 5 mdtL multidrug efflux system protein

GAACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTCC  >  minE/2481742‑2481803
                                                             |
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCTATCAGCATATTcc  <  1:1958192/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:469188/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2512023/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2541952/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2653031/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2737116/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2770623/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:289104/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:308285/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:3086453/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:3293022/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:445223/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2461747/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:501530/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:706420/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:708324/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:726974/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:756782/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:800113/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:843839/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:845462/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:913214/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:991866/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1609556/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1384808/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1425184/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1474057/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1514192/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1555387/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1563536/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:158586/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:159318/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1601893/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1113368/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1633121/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1646076/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1693833/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:176550/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1807564/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:185389/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1868574/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:1871805/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:216036/62‑1 (MQ=255)
gaACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:2423228/62‑1 (MQ=255)
                        tATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTcc  <  1:7195/38‑1 (MQ=255)
                                                             |
GAACATAATCAGCAACAGGCTCACTATGCTACAGGCAATCAGAATCCCGATCAGCATATTCC  >  minE/2481742‑2481803

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: