Missing coverage evidence...
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CCGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTGG  >  minE/2484031‑2484092                                                              | ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCTAACTgg  <  1:3074499/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2468896/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2467420/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2486968/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2490354/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2491182/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:260131/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2739942/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2758544/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2791037/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2823659/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2856021/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2902175/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:3205435/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:326937/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:351731/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:407477/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:424921/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:451213/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:585447/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:66086/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:806416/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:808183/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2334396/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1117006/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1172447/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1290396/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1346593/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1411140/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1417816/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1495843/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1628991/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1804568/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1826445/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1831125/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2018209/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2066029/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2077612/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2105433/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2215200/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2216303/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2231635/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:2260622/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1011188/62‑1 (MQ=255) ccGTGCGGAGAATGCCCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1293469/62‑1 (MQ=255)  cGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:1014091/61‑1 (MQ=255)                  cTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACTGGCCGCCTGTTCCGAACTgg  <  1:538831/45‑1 (MQ=255)                                                              | CCGTGCGGAGAATGCGCCTTGCAGCGAGTTAAGTGCCGAACGGGCCGCCTGTTCCGAACTGG  >  minE/2484031‑2484092

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑