Missing coverage evidence...
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TCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACCGG  >  minE/2503435‑2503496                                                              | tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:511403/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2479360/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2530884/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2595108/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:263116/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:264703/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2811258/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:3235734/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:3286201/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2257067/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:534025/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:571890/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:648204/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:669782/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:758801/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:834431/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:897683/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:92327/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:169770/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1083850/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1232553/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1293471/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1557154/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1568603/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1659997/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1691971/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1026508/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1713769/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1850213/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1938206/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1958271/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1968932/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2022492/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:2165100/62‑1 (MQ=255) tCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:224597/62‑1 (MQ=255)  cGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:5242/61‑1 (MQ=255)  cGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACcgg  <  1:1146559/61‑1 (MQ=255)                                                              | TCGGTTAGCCTGTTCCTGATGATTGCCTTCTACGCCTTAAGCGGCTTTTTCCAGAGTACCGG  >  minE/2503435‑2503496

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑