Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2518023	2518053	31	46 [0]	[0] 16	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

AACTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTTGT  >  minE/2517961‑2518022                                                              | aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:3231875/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:242995/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1112081/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2625918/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2674067/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2729504/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2812813/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2998835/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:3060993/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:3129936/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:3216211/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2520369/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:387376/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:399706/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:44378/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:471765/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:573365/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:601228/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:699704/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:724823/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:84649/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1647517/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1153757/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1209475/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1315232/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1349415/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:140334/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1435218/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1436430/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1492631/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1528208/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1888757/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1896817/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:192382/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1972968/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:211739/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2199188/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2204861/62‑1 (MQ=255) aaCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2288681/62‑1 (MQ=255)  aCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:3155831/61‑1 (MQ=255)  aCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2953923/61‑1 (MQ=255)  aCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:1422938/61‑1 (MQ=255)  aCTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2271504/61‑1 (MQ=255)                 ttGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:2414/46‑1 (MQ=255)                       cTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:818191/40‑1 (MQ=255)                           agcagGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTtgt  <  1:829484/36‑1 (MQ=255)                                                              | AACTACCGGCGCTCTGTTGCAGCTCCAGCAGGCTTTGCATCCAGCGCTGGGCGCGGATTTGT  >  minE/2517961‑2518022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑