Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2518696 2518715 20 111 [0] [0] 11 spoT bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

Only 100 of 111 total aligned reads displayed.

TACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCA  >  minE/2518654‑2518695
                                         |
tccGGTCGGCAAGGTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3074335/40‑1 (MQ=38)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:464628/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:490287/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:446673/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3281055/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:324850/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3190115/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3188233/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3162974/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3156171/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3100772/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3080143/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3075057/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:302683/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2983349/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2977333/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2917605/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2907026/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2741559/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2718181/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2680712/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2672015/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1070439/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2613976/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:687430/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:943267/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:935259/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:841026/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:835792/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:834448/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:817112/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:774223/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:766843/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:750307/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:697537/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:687825/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2639717/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:681579/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:677925/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:676545/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:669164/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:656402/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:612631/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:587864/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:584501/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:579506/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:55791/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:525525/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:139343/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1719809/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2603089/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1652420/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:161069/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:153375/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1531327/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1509490/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1508845/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1477176/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1452985/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1411401/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1666289/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1324116/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1321831/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1298976/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1259200/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1208658/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1147115/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1139154/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1135054/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1125595/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1093765/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1089236/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2283105/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2586511/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2573173/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2556621/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2533022/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:246643/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2397867/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2354064/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2308450/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2285627/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1742341/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2186582/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2162532/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2160119/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2157731/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2098185/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2047927/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1815254/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1804578/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCAGATATCCTGCa  <  1:1275913/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTTTGATAAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:666273/42‑1 (MQ=255)
tACGGTCGGCAAGTGTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3245229/42‑1 (MQ=255)
tACGCTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:3174194/42‑1 (MQ=255)
tACAGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1429243/42‑1 (MQ=255)
 aCGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:1169083/41‑1 (MQ=255)
  cGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2145446/40‑1 (MQ=255)
      cGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2443924/36‑1 (MQ=255)
       ggCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCa  <  1:2868151/35‑1 (MQ=255)
                                         |
TACGGTCGGCAAGTTTGATGAGGATGACGCGGATATCCTGCA  >  minE/2518654‑2518695

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: