Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2518838	2518851	14	39 [0]	[0] 28	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

ACCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGC  >  minE/2518776‑2518837                                                              | acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:3257055/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2245247/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2245912/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2302457/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2377108/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2717303/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2723762/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2854244/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2897572/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:3068955/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2164945/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:3290026/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:33602/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:499689/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:52208/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:556843/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:640629/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:75097/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:813105/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:947255/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1810969/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1141704/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:122215/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:138053/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1438795/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1471923/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:15199/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1522957/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:15636/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1596706/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1115606/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1875589/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:19054/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1910072/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:1935058/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2077264/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2083868/62‑1 (MQ=255) acCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2112889/62‑1 (MQ=255) acCCCATCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGc  <  1:2156419/62‑1 (MQ=255)                                                              | ACCCCCTCTACCAGCTCGGCGACGCTTTTACCAAAAAGCTGTTCCATATCCTGGTAGGTGGC  >  minE/2518776‑2518837

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑