Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539749	2539804	56	53 [0]	[1] 51	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

TTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATT  >  minE/2539690‑2539748                                                           | ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:3139986/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2319851/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2359038/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2397647/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2417493/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2421349/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2590436/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2746706/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2754362/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2781105/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2781637/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2909106/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2927148/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2311574/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:3147410/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:3218667/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:462431/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:498021/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:531770/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:599070/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:606449/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:659996/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:760384/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:764517/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:797954/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:866206/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1740582/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1103252/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1141352/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1160733/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1228882/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1331836/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:134090/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1451467/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:153459/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1576613/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1586619/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1684395/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:174027/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1054560/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1887321/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1960824/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:1998530/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2012095/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2033190/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2035496/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2051911/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2148716/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2187042/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2205515/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2237846/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAAtt  >  1:2262965/1‑59 (MQ=255) ttCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTT‑TATAGAAtt  >  1:3176438/1‑58 (MQ=255)                                                           | TTCAAAAAATTGCAAAGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATT  >  minE/2539690‑2539748

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑