Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2543170	2543184	15	11 [0]	[1] 4	rfaK	lipopolysaccharide core biosynthesis

TTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGT  >  minE/2543110‑2543169                                                            | tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1079649/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1178428/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1410297/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1580248/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1617685/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1900621/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:1924287/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:2690663/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:765573/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:872821/1‑60 (MQ=255) tttAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGt  >  1:893085/1‑60 (MQ=255)                                                            | TTTAATTTGGTCCCCGAATCATCATAAATCTATACAAATAGTATCCCCAACATATACGGT  >  minE/2543110‑2543169

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑