Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2589191	2589196	6	39 [0]	[0] 34	gadE	DNA‑binding transcriptional activator

CATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCA  >  minE/2589129‑2589190                                                              | cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:3282903/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2767318/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2775144/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2845825/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2883427/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2902192/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:3141319/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:3144907/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:3206161/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:3272644/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2736737/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:503872/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:580993/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:586258/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:626725/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:633509/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:715213/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:914058/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:991070/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:997084/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2135411/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1153569/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1391348/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1759865/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1776110/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1784756/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1912142/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1919707/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:193918/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1962491/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:1076748/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2281203/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2299978/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2346189/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2394984/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2472739/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2489196/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2546145/1‑62 (MQ=255) cATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCa  >  1:2688669/1‑62 (MQ=255)                                                              | CATCTAATTTCTCCAGAAATTTAATCGCTTCTTCATCAAGGATATGATTGTGATAGGTATCA  >  minE/2589129‑2589190

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑