Missing coverage evidence...
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GACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCGA  >  minE/2608934‑2608995                                                              | gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTGGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2923228/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:3179756/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1019967/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2448556/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2590189/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2659999/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2697111/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2726056/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:3080746/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:3090325/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2438991/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:358043/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:531960/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:534261/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:648176/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:803583/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:90288/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:924330/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:991782/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1593287/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1052373/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1057930/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1092677/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1156029/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1227870/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1527161/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1542946/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1555717/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2260406/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1655846/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1829701/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1836408/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1849397/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1909633/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:195266/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:1990966/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2200805/62‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGGTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:779011/62‑1 (MQ=255)  aCGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCga  <  1:2610778/61‑1 (MQ=255)                                                              | GACGCGCTGGAGCTGGCCGCCGCTTAACTGCGGTGGGCGTTTGTCGAGAACGCTGTCATCGA  >  minE/2608934‑2608995

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑